Exemples de stages

N.B.: Seul un extrait de la liste des stages réalisés est présenté ici. Aucun critère n’a été appliqué pour cette sélection, si ce n’est la couverture d’un nombre d’années représentatif.

• Comparaison topologique des differentes classes de lipases en vue de comprendre leurs caractéristiques d’énantiolsélectivité.
  Unité Fonctionnalité et Ingénierie des Protéines (UFIP) – CNRS FRE 3478, Nantes
• Mise en place d’outils et comparaison de méthodes d’analyses statistiques des données de crible sur puce à cellules
  C.E.A., Grenoble
• Implication des éléments transposables dans l’apparition d’une résistance au Bti chez le moustique Aedes aegypti
  Laboratoire d’Ecologie Alpine – LECA, Grenoble
• Assistance au déploiement de Bookmaster
  Société Eurofins, Nantes
• Intégration de données transcriptomiques pour la méta-analyse
  Institut du Thorax -Unité Inserm UMR 1087 / CNRS UMR 6291, Nantes
• Traitement et analyse de données d’association génome entier dans le cas de maladies valvulaires cardiaques
  Institut du Thorax -Unité Inserm UMR 1087 / CNRS UMR 6291, Nantes
• Automatisation des rapports Air à l’émission
  Société Eurofins, Orléans
• Développement d’un outil bioinformatique d’aide à l’analyse d’aide à l’analyse de données biologiques isSues d’expériences de protéomique
  Institut de Médecine Tropicale du service de Santé des Armées, Marseille
• Développement d’une application pour standardiser le génotypage de pathogènes par la technique MLVA
  Institut Pasteur, Paris

• Modélisation de potentiels d’action cardiaque
  Institut du Thorax -Unité Inserm UMR 1087 / CNRS UMR 6291, Nantes
• MADMIX : outil d’intégration de données de génomiQue, de transcriptomique et de ChIP-chip
  Institut du Thorax -Unité Inserm UMR 1087 / CNRS UMR 6291, Nantes
• recherche de microsatellites, design automatisé de primers et PCR in silico dans les bases de données internationales
  INRA – UMR APBV, Rennes
• Création et amélioration des feuilles de travail électroniques des laboratoires EUROFINS
  Société Eurofins, Nantes
• Développement de scripts d’analyse statistique de données écologiques de terrain
  Institut Méditerranéen d’Ecologie et de Paléoécologie – UMR CNRS 6116, Marseille
• Méthodes d’exploration de données publiques de puces à ADN
  Institut du Thorax -Unité Inserm UMR 1087 / CNRS UMR 6291, Nantes
• Développement de fonctionnalités dans un LIMS
  Institut National de Police Scientifique, Marseille

• Développement d’outils informatiques d’automatisation du séquençage
  Société GenoScreen / Institut Pasteur, Lille
• Développement d’une base de données de récepteurs couplés aux protéines : mise à jour des données et des alignements multiples de séquences
  Laboratoire de Biologie Neurovasculaire Intégrée – UMR CNRS 6214 – INSERM U771, Angers

• Gestion informatisée d’une bio-banque
  Société IDBC, Nantes

• Développement d’un logiciel de comptage pour les microalgues
  Société Algenics, Nantes
• développement d’un ensemble d’applications pour la détection de polluants par bioluminescence bactériene
  UMR CNRS 6144 – GEPEA, La Roche sur Yon

• Réalisation d’une application de monitoring biologique
  Société Biofortis, Nantes

• Analyse du polymorphisme de type SNP et indels chez une espèce polyploïde hétérozygote : le rosier
  Laboratoire de Génétique et Horticulture Centre INRA d’Angers-Nantes, UMR 1259 GenHort, Angers
• Développement d’une base de données de récepteurs couplés aux protéines G
  Laboratoire de Biologie Neurovasculaire Intégrée – UMR CNRS 6214 – INSERM U771, Angers
• Création d’une base de données biologiques et de son interface

  Société AtlanticBoneScreen, Nantes

• Développement et mise en place du LIMS
  Société TcLand Expression, Nantes

• Recherche in silico des éléments transposables dans le génome de la tique Ixodes scapularis
  UMR INRA-Oniris 1300 BioEpAR (Biologie, Epidémiologie, Analyse deRisque en santé animale), Nantes

• Développement et optimisation d’outils informatiques pour criblage génétique à haut débit
  Institut du Thorax -Unité Inserm UMR 1087 / CNRS UMR 6291, Nantes

• Développement d’une application de gestion de données spectrales de référence
  INRA – Unité BIA, Nantes

• Mise en place d’une suite d’exploitation des résultats d’analyses d’associations génome entier (GWAS)
  Institut du Thorax -Unité Inserm UMR 1087 / CNRS UMR 6291, Nantes

• Amélioration et analyse de prédictions conformationnelles peptidiques
  Laboratoire de Biologie Neurovasculaire Intégrée – UMR CNRS 6214 – INSERM U771, Angers
• Création d’une boîte à outils pour l’utilisation du logiciel iQUANTITATOR et l’extraction / analyse des résultats – applications sur des données de tumeurs colorectales mutées sur le gène KRAS
  CRCNA-INSERM U892 / CRLCC Paul Papin, Angers

• Analyse à large échelle de l’épissage alternatif dans le cancer du sein
  UMR INSERM 590 – Centre Léon Bérard – OncoGénèse et Progression Tumorale, Lyon

• Méthode de comparaison des profils d’expression : MADness
  Institut du Thorax -Unité Inserm UMR 1087 / CNRS UMR 6291, Nantes